Prot\u00e9omique? Peut-\u00eatre d\u00e9couvrez-vous ici pour la premi\u00e8re fois ce n\u00e9ologisme appel\u00e9 \u00e0 prendre la succession de la g\u00e9nomique, certes encore omnipr\u00e9sente, mais peut-\u00eatre plus pour longtemps.<\/p>\n
L’enjeu: gu\u00e9rir de nombreuses maladies et allonger sensiblement l’esp\u00e9rance de vie. Non plus avec des substances chimiques traditionnelles, mais avec ces constituants du vivant que sont les prot\u00e9ines (substances complexes constitu\u00e9es par l’association d’acides amin\u00e9s et indispensable \u00e0 tous les organismes vivants).<\/p>\n
Depuis quelques ann\u00e9es, le s\u00e9quen\u00e7age de nombreux g\u00e8nes et le d\u00e9cryptage du g\u00e9nome humain ont conduit \u00e0 l’\u00e9mergence des concepts de prot\u00e9ome, puis de prot\u00e9omique. Le prot\u00e9ome d\u00e9signe l’ensemble des prot\u00e9ines exprim\u00e9es par un g\u00e9nome \u00e0 un moment pr\u00e9cis en r\u00e9ponse \u00e0 un environnement donn\u00e9. La prot\u00e9omique, science jeune, identifie de nouvelles prot\u00e9ines pour en comprendre la fonction et l’importance en pathologie afin de concevoir de nouveaux traitements.<\/p>\n
Selon la tr\u00e8s s\u00e9rieuse revue Nature (vol. 402, 16.12.99), cette discipline \u00e9mergente s’appr\u00eaterait m\u00eame \u00e0 \u00e9vincer la g\u00e9nomique.<\/p>\n
L’explication est peut-\u00eatre \u00e0 chercher du c\u00f4t\u00e9 du sida et de la maladie de la vache folle. Ces deux affections ont induit une certaine d\u00e9sillusion en mati\u00e8re de th\u00e9rapie g\u00e9nique. La s\u00e9quence du principal virus du sida a \u00e9t\u00e9 \u00e9tablie en 1985 et quinze ans plus tard, la cl\u00e9 n’a toujours pas \u00e9t\u00e9 trouv\u00e9e. Idem pour la mucoviscidose. Autre illustration des limites actuelles de la g\u00e9n\u00e9tique: la maladie de la vache folle, qui est provoqu\u00e9e par une prot\u00e9ine (le prion) dont l’action ne peut cependant pas s’expliquer par les g\u00e8nes.<\/p>\n
G\u00e9nomique et prot\u00e9omique sont des domaines de recherche compl\u00e9mentaires. Pour que la g\u00e9nomique dispense l’ensemble de ses potentiels, il est logique de s’attaquer \u00e0 l’identification des prot\u00e9ines. <\/p>\n
En effet, les g\u00e8nes s’acquittent de leurs fonctions cellulaires par les prot\u00e9ines, en les encodant. Un organisme ne renferme qu’un seul ensemble d’instructions g\u00e9n\u00e9tiques, mais l’expression de ces instructions par une s\u00e9rie de prot\u00e9ines varie selon les tissus, et m\u00eame dans un m\u00eame tissu dans des conditions diff\u00e9rentes. Un univers extr\u00eament complexe qu’il s’agit de d\u00e9fricher.<\/p>\n
L’Universit\u00e9 de Gen\u00e8ve a acquis une r\u00e9putation d’excellence internationale dans ce domaine gr\u00e2ce au professeur Denis Hochstrasser et \u00e0 son \u00e9quipe. Son D\u00e9partement<\/a> de biochimie m\u00e9dicale occupe une place de leader dans le s\u00e9quen\u00e7age et l’identification des prot\u00e9ines.<\/p>\n D’ailleurs, le terme de prot\u00e9ome, aujourd’hui internationalement utilis\u00e9, a \u00e9t\u00e9 invent\u00e9 par Marc Wilkins alors membre de l’\u00e9quipe du professeur Hochstrasser. Ce type de recherche fait appel \u00e0 de nouveaux outils technologiques et bioinformatiques extr\u00eamement pointus. Or l’\u00e9quipe genevoise a d\u00e9velopp\u00e9 un scanner mol\u00e9culaire tr\u00e8s performant pour r\u00e9v\u00e9ler la \u00ab\u00a0signature\u00a0\u00bb des prot\u00e9ines.<\/p>\n L’avance suisse dans ce domaine est imputable \u00e9galement \u00e0 l’Institut suisse de bioinformatique<\/a>, cr\u00e9\u00e9 en 1998. II a d\u00e9velopp\u00e9 la plus grande banque de donn\u00e9es de prot\u00e9ines appel\u00e9e SWISS PROT<\/a> qui contient des informations sur plus de 85\u2019000 prot\u00e9ines et est consult\u00e9e par plus de 200\u2019000 chercheurs.<\/p>\n C’est en \u00ab\u00a0pole position\u00a0\u00bb que la Suisse entame ce que certains n’h\u00e9sitent pas \u00e0 qualifier de \u00ab\u00a0deuxi\u00e8me r\u00e9volution scientifique\u00a0\u00bb. D’autant que du c\u00f4t\u00e9 de l’industrie priv\u00e9e, on a flair\u00e9 l’ampleur du march\u00e9 potentiel.<\/p>\n Les prot\u00e9ines livreront-elles les m\u00e9dicaments du futur? Les millions actuellement investis dans ce secteur de la recherche attestent d’un tel pari. Un exemple: l’entreprise de biotechnologie Cytos, install\u00e9e \u00e0 Schlieren (canton de Zurich), a mis au point un proc\u00e9d\u00e9 baptis\u00e9 DELphi qui permet de tester l’\u00e9ventuel effet th\u00e9rapeutique de prot\u00e9ines.<\/p>\n Cot\u00e9e au SWX New Market, elle vient de r\u00e9unir 50 millions de francs suisses (environ 200 millions de francs fran\u00e7ais) pour les mettre \u00e0 la disposition de ses chasseurs de prot\u00e9ines. Parmi eux, le prix Nobel Rolf Zinkernagel. Son projet: modifier le syst\u00e8me immunitaire de fa\u00e7on \u00e0 lui faire produire des anticorps (prot\u00e9ines) destin\u00e9s \u00e0 lutter contre les cellules tumorales. Bref, ni plus ni moins que le vaccin contre le cancer.<\/p>\n Vous l’aurez compris, les prot\u00e9ines devraient d\u00e9clencher le prochain pas innovatif dans le traitement des maladies les plus diverses. Les premiers r\u00e9sultats commencent \u00e0 arriver. Apr\u00e8s des succ\u00e8s avec l’insuline et l’hormone de croissance, nous apprenions la semaine derni\u00e8re que des chercheurs canadiens avaient d\u00e9couvert une prot\u00e9ine contre le cancer du colon (p110g) efficace chez la souris. Et chez l’homme? <\/p>\n Les articles de la presse sp\u00e9cialis\u00e9e sont tous extr\u00eamement optimistes. Je n’y ai pas trouv\u00e9 trace d’un questionnement sur les effets secondaires possibles de ce type de traitement. Or les venins (prot\u00e9ines) d’abeille ou de serpent peuvent d\u00e9clencher des r\u00e9actions mortelles… Et le d\u00e9bat bio\u00e9thique, sur quelles conclusions d\u00e9bouchera-t-il? Quelques nuages pourraient bien voiler le ciel radieux d\u00e9crit par les biologistes. <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Il faut conna\u00eetre ce mot, prot\u00e9omique. 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