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Sur l\u2019\u00e9cran, des formes color\u00e9es de rouge et de bleu s\u2019animent. Elles repr\u00e9sentent une nouvelle mol\u00e9cule d\u00e9couverte par l\u2019\u00e9quipe du professeur Olivier Michielin. Elle deviendra peut-\u00eatre un m\u00e9dicament candidat contre le m\u00e9lanome, le cancer de la peau le plus agressif.<\/p>\n
Oncologue au CHUV, le chercheur de l\u2019Universit\u00e9 de Lausanne est un sp\u00e9cialiste de la simulation informatique des mol\u00e9cules, une m\u00e9thode en plein essor \u00e0 m\u00eame d\u2019identifier rapidement de nouveaux m\u00e9dicaments prometteurs.<\/p>\n
L\u2019\u00e9quipe d’Olivier Michielin a d\u00e9couvert une mol\u00e9cule capable de contrecarrer un moyen utilis\u00e9 par certaines cellules canc\u00e9reuses pour \u00e9chapper au syst\u00e8me immunitaire: les tumeurs produisent un enzyme nocif qui affaiblit les capacit\u00e9s de d\u00e9fense des globules blancs. \u00abIl d\u00e9truit un acide amin\u00e9 essentiel aux globules blancs, explique le m\u00e9decin. Pour emp\u00eacher l\u2019action de cet enzyme, il faut trouver une mol\u00e9cule qui puisse se fixer sur lui. Nos simulations sur ordinateur nous ont permis d\u2019identifier des nouvelles entit\u00e9s qui \u00e9pousent parfaitement la forme de l\u2019agent nocif et peuvent ainsi le neutraliser.\u00bb Les premiers compos\u00e9s chimiques ont \u00e9t\u00e9 test\u00e9s avec succ\u00e8s sur des souris.<\/p>\n
In vivo, in vitro, in silico<\/strong> Mais d\u00e9couvrir de nouvelles mol\u00e9cules n\u2019est pas une t\u00e2che ais\u00e9e — le nombre de combinaisons est virtuellement infini. L\u2019\u00e9quipe lausannoise utilise les ordinateurs de Vital-IT, une infrastructure informatique consacr\u00e9e aux sciences de la vie mise sur pied par les Universit\u00e9s de Lausanne et de Gen\u00e8ve et par l\u2019EPFL. Les chercheurs vont \u00e9galement pouvoir utiliser le super-ordinateur IBM Blue Gene de la plateforme l\u00e9manique Cadmos, un monstre de puissance capable d\u2019effectuer 56’000 milliards d\u2019op\u00e9rations par seconde (soit 10\u2019000 fois plus qu\u2019un ordinateur de bureau standard).<\/p>\n L\u2019avantage de la simulation num\u00e9rique est de pouvoir d\u00e9couvrir tr\u00e8s rapidement de nouveaux compos\u00e9s sans passer par d\u2019innombrables essais chimiques, souligne le chercheur: \u00abIl est important de disposer de plusieurs familles de mol\u00e9cules avant de passer aux essais cliniques sur les humains, car il arrive que des compos\u00e9s chimiques soient mal absorb\u00e9s par l\u2019organisme ou s\u2019av\u00e8rent toxiques.\u00bb<\/p>\n Am\u00e9liorer les prot\u00e9ines<\/strong> Un traitement consisterait \u00e0 faire fabriquer cette prot\u00e9ine am\u00e9lior\u00e9e par les globules blancs. L\u2019id\u00e9e est d\u2019ins\u00e9rer le bout d\u2019ADN codant le r\u00e9cepteur dans des globules blancs extraits du patient et cultiv\u00e9s in vitro. Une fois multipli\u00e9s, ces derniers sont r\u00e9inject\u00e9s dans le corps afin de lutter contre la maladie, une approche inspir\u00e9e de la th\u00e9rapie g\u00e9nique.<\/p>\n Mais si ces approches ont d\u00e9j\u00e0 d\u00e9montr\u00e9 leur efficacit\u00e9 en labo, Olivier Michielin rappelle une dure r\u00e9alit\u00e9 de la recherche biom\u00e9dicale: \u00abNous sommes capables de gu\u00e9rir pratiquement tous les cancers, mais seulement sur des cultures cellulaires ou des souris.\u00bb<\/p>\n Pour le chercheur, l\u2019ordinateur n\u2019est qu\u2019un outil: son objectif est de soigner les patients. Plus de 50% de son activit\u00e9 est d\u2019ailleurs d\u00e9di\u00e9e \u00e0 la prise en charge des patients en oncologie: \u00abTraiter des patients m\u2019aide \u00e0 voir directement l\u2019efficacit\u00e9 des nouveaux traitements, mais cela me confronte \u00e9galement aux situations o\u00f9 les options th\u00e9rapeutiques sont insuffisantes. C\u2019est une grande source de motivation pour faire avancer nos projets au laboratoire.\u00bb<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" La technologie informatique permet d\u2019identifier de nouvelles mol\u00e9cules. Une acc\u00e9l\u00e9ration de la recherche m\u00e9dicale qui offre une arme de plus dans la lutte contre le cancer. Explications.<\/p>\n","protected":false},"author":19478,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[7],"tags":[],"class_list":["post-3589","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-technophile","technophile"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3589","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/19478"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=3589"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3589\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=3589"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=3589"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=3589"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}
\nCette nouvelle chimie informatique compl\u00e8te les approches \u00abin vivo\u00bb, qui consistent \u00e0 tester des compos\u00e9s sur des \u00eatres vivants, et \u00abin vitro\u00bb, o\u00f9 des cultures cellulaires sont \u00e9tudi\u00e9es dans des \u00e9prouvettes. Surnomm\u00e9e \u00abin silico\u00bb en r\u00e9f\u00e9rence au silicium contenu dans les puces informatiques, cette approche exige de rassembler m\u00e9decins, informaticiens, chimistes et physiciens. Olivier Michielin a d\u2019ailleurs suivi une double formation de m\u00e9decin \u00e0 l\u2019UNIL et de physicien \u00e0 l\u2019EPFL. De nombreux m\u00e9canismes biologiques passent par l\u2019embo\u00eetement de deux mol\u00e9cules et la conception informatique de m\u00e9dicaments revient souvent \u00e0 trouver une \u00abcl\u00e9\u00bb correspondant le mieux possible \u00e0 une \u00abserrure\u00bb.<\/p>\n
\nUn second projet d’Olivier Michielin vise \u00e0 aider les globules blancs \u00e0 reconna\u00eetre les cellules canc\u00e9reuses et surtout \u00e0 mieux s\u2019y fixer, car c\u2019est ainsi qu\u2019ils peuvent les d\u00e9truire. \u00abNous sommes partis de la prot\u00e9ine naturellement pr\u00e9sente sur les globules blancs, poursuit le chercheur. L\u2019efficacit\u00e9 de ce r\u00e9cepteur n\u2019est pas optimale, car il ne colle pas parfaitement aux marqueurs situ\u00e9s \u00e0 la surface des cellules tumorales. Nous l\u2019avons donc am\u00e9lior\u00e9 sur ordinateur et trouv\u00e9 la forme qui correspond le mieux au marqueur.\u00bb<\/p>\n