{"id":3263,"date":"2010-10-14T17:58:16","date_gmt":"2010-10-14T15:58:16","guid":{"rendered":"http:\/\/www.largeur.com\/?p=3263"},"modified":"2011-06-14T11:11:58","modified_gmt":"2011-06-14T09:11:58","slug":"futur","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/largeur.com\/?p=3263","title":{"rendered":"D\u00e9cryptage ADN pour tous: la course est lanc\u00e9e"},"content":{"rendered":"

\"large151010.jpg\"Trois milliards de dollars en 2000, 10\u2019000 dollars en 2010. La r\u00e9duction extraordinaire du co\u00fbt du d\u00e9cryptage de l\u2019ADN complet de l\u2019homme pr\u00e9figure une r\u00e9volution \u00e0 la hauteur de l\u2019arriv\u00e9e d\u2019internet: l\u2019\u00e8re de la g\u00e9n\u00e9tique et de la m\u00e9decine personnalis\u00e9e, un nouveau paradigme qui fait saliver les pharmas. Ce bond technologique devrait permettre de d\u00e9terminer chez quels patients un certain m\u00e9dicament peut fonctionner. <\/p>\n

Le nerf de la guerre est le d\u00e9cryptage (ou s\u00e9quen\u00e7age) de l\u2019information g\u00e9n\u00e9tique. Les instruments de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration parviennent d\u00e9sormais \u00e0 lire rapidement non pas seulement des g\u00e9nomes partiels, mais des ADN entiers compos\u00e9s de milliards de bases (les mol\u00e9cules encodant l\u2019information g\u00e9n\u00e9tique et baptis\u00e9es A, C, T et G). Pour \u00e9quiper les labos de recherche qui tournent \u00e0 plein r\u00e9gime, une poign\u00e9e de firmes am\u00e9ricaines d\u00e9veloppent et vendent des machines complexes, dont la valeur d\u00e9passe le demi-million de dollars: Illumina, Life Technologies ou encore 454 Life Sciences (acquise en 2008 par Roche). <\/p>\n

Un secteur \u00e0 haut risque <\/strong>
\nLe march\u00e9 est actuellement estim\u00e9 \u00e0 quelque 2 milliards de dollars. Pour qu\u2019il grandisse encore, le volume doit augmenter plus rapidement que les prix ne chutent\u2026 Entre 2003 et 2006, sa valeur avait d\u2019ailleurs stagn\u00e9 en dessous du milliard. \u00abLe march\u00e9 va se d\u00e9velopper mais il est difficile de d\u00e9terminer \u00e0 quelle vitesse, estime Derik de Bruin, analyste biotech chez UBS. A court terme, c\u2019est un domaine \u00e0 haut risque. Les labos de recherche publique, par exemple, d\u00e9pendent de financements gouvernementaux qui sont touch\u00e9s par la crise.\u00bb <\/p>\n

Les avanc\u00e9es technologiques sont extr\u00eamement rapides et la comp\u00e9tition est ardue. Les rachats, fusions et spin-out se sont succ\u00e9d\u00e9 avec un rythme soutenu. \u00abD\u2019apr\u00e8s la taille du march\u00e9, je pense qu\u2019il y a de la place pour deux ou trois acteurs principaux, commente Chris Mc Leod, CEO de 454 Life Sciences. Mais la technologie n\u2019est pas tout, et elle continuera d\u2019\u00e9voluer de toute fa\u00e7on. Il faut surtout se pencher sur le management et la strat\u00e9gie de l\u2019entreprise.\u00bb En l\u2019occurrence, l\u2019entreprise de Chris Mc Leod a rejoint le giron de Roche, une pharma qui a clairement annonc\u00e9 son int\u00e9r\u00eat pour le domaine du diagnostic, en particulier bas\u00e9 sur l\u2019ADN. <\/p>\n

\u00abNous voulons syst\u00e9matiquement incorporer les techniques de diagnostic dans le d\u00e9veloppement de nos m\u00e9dicaments, indique Claudia Schmitt, porte-parole de la firme helv\u00e9tique. La m\u00e9decine personnalis\u00e9e se positionne au c\u0153ur de notre strat\u00e9gie\u00bb. Si ce nouveau paradigme soul\u00e8ve d\u2019\u00e9normes espoirs, ils tardent n\u00e9anmoins \u00e0 se concr\u00e9tiser, car la g\u00e9n\u00e9tique s\u2019av\u00e8re plus complexe que pr\u00e9vu\u2026 Mais de toute mani\u00e8re, les labos de recherche continueront \u00e0 s\u00e9quencer \u00e0 tour de bras, en particulier en oncologie pour analyser syst\u00e9matiquement les tumeurs chez des milliers de patients, cela dans l\u2019espoir de trouver des nouvelles cibles th\u00e9rapeutiques. <\/p>\n

Boom des besoins informatiques<\/strong>
\nLa g\u00e9n\u00e9tique ne se d\u00e9veloppe de loin pas uniquement dans le domaine de la sant\u00e9. Les biologistes s\u00e9quencent esp\u00e8ce apr\u00e8s esp\u00e8ce, les compagnies d\u2019agro-business se penchent sur l\u2019ADN des plantes et les \u00e9leveurs s\u2019int\u00e9ressent aux races de cochons qui s\u2019engraissent rapidement\u2026 <\/p>\n

\u00abC\u2019est une v\u00e9ritable arche de No\u00e9 qui est d\u00e9crypt\u00e9e\u00bb, r\u00e9sume Derik de Bruin d\u2019UBS. \u00abLe s\u00e9quen\u00e7age joue \u00e9galement un r\u00f4le important en bio-ing\u00e9nierie, avec le but de d\u00e9velopper des bact\u00e9ries capables par exemple de produire du bio-fuel ou des plastiques\u00bb, ajoute Chris Mc Leod de 454 Life Sciences. <\/p>\n

Ce mouvement entra\u00eene une activit\u00e9 secondaire: le traitement informatique n\u00e9cessaire pour interpr\u00e9ter les r\u00e9sultats. \u00abL\u2019analyse par ordinateur est devenue un goulet d\u2019\u00e9tranglement, souligne Chris Mc Leod. Les vrais co\u00fbts du s\u00e9quen\u00e7age se sont d\u00e9plac\u00e9s des op\u00e9rations chimiques \u00e0 l\u2019analyse des \u00e9normes quantit\u00e9s de donn\u00e9es produites.\u00bb Ce march\u00e9 reste encore aux mains des logiciels libres d\u2019acc\u00e8s d\u00e9velopp\u00e9s par les universit\u00e9s. Mais les titans de l\u2019informatique sont d\u00e9j\u00e0 en embuscade. Google a investi en 2007 dans 23andMe, une compagnie qui commercialise des analyses g\u00e9n\u00e9tiques rudimentaires. En ligne de mire du g\u00e9ant californien — et d\u2019autres mammouths tels que General Electrics et IBM –, le march\u00e9 de la sant\u00e9 \u00e9lectronique et des gigantesques bases de donn\u00e9es de patients qu\u2019il faudra g\u00e9rer.
\n_______<\/p>\n

Cap sur le g\u00e9nome \u00e0 1000 dollars<\/strong><\/p>\n

En janvier 2010, Illumina annonce la sortie de sa nouvelle machine capable de lire 25 milliards de bases d\u2019ADN par jour, ce qui, selon son CEO Jay Flatley, placera le g\u00e9nome humain \u00e0 moins de $10\u2019000. Soit 100\u2019000 fois moins cher qu\u2019il y a dix ans\u2026 <\/p>\n

Le co\u00fbt des deux premi\u00e8res s\u00e9quences quasi compl\u00e8tes du g\u00e9nome de l\u2019homme, publi\u00e9es simultan\u00e9ment en 2001, est estim\u00e9 \u00e0 3 milliards de dollars pour l\u2019effort public (le Human Genome Project) et 300 millions de dollars pour son concurrent priv\u00e9 men\u00e9s par Craig Venter. <\/p>\n

En 2007 sont annonc\u00e9s les premiers g\u00e9nomes \u00e0 la fois complets et individuels, obtenus \u00e0 partir de l\u2019ADN des deux p\u00e8res fondateurs, qui s\u2019offrent ainsi une place dans la post\u00e9rit\u00e9. Leurs co\u00fbts? Deux millions pour le g\u00e9nome de James Watson (qui avait lanc\u00e9 le Human Genome Project en 1990 et d\u00e9couvert la structure de l\u2019ADN en 1953), d\u00e9crypt\u00e9 par une machine de 454 Life Science. Le g\u00e9nome de Craig Venter, lui, revient \u00e0 70 millions et se fait sur un instrument d\u2019Applied Biosystems, une firme qui deviendra Life Technologies en 2008. <\/p>\n

Depuis, les annonces se succ\u00e8dent: premier g\u00e9nome complet d\u2019un Asiatique (par Illumina en 2008) et d\u2019un homme de N\u00e9andertal (par 454 Life Sciences en 2008) ou encore d\u2019une \u00abfemme non anonyme\u00bb (l\u2019actrice Glenn Close, 2010, par Illumina). Avec l\u2019effondrement des prix, les exp\u00e9riences de ce type vont redoubler. Complete Genomics annonce vouloir s\u00e9quencer 5000 g\u00e9nomes en 2010, alors que le directeur d\u2019Illumina, James Flatley, pr\u00e9dit qu\u2019en 2019, une lecture compl\u00e8te de l\u2019ADN sera devenue une routine pour chaque nouveau-n\u00e9. Le co\u00fbt d\u2019un g\u00e9nome reste indicatif \u2013 il s\u2019agit avant tout d\u2019effets d\u2019annonce. \u00abOn ne sait pas toujours ce qui est exactement compris dans ces prix: souvent, il s\u2019agit uniquement du co\u00fbt des r\u00e9actifs sans inclure l\u2019analyse des r\u00e9sultats\u00bb, note Chris Mc Leod, CEO de 454 Life Science. Mais m\u00eame si ces jalons restent arbitraires, la barri\u00e8re psychologique de g\u00e9nome \u00e0 1000 dollars se rapproche \u00e0 grands pas. Elle symbolise une chute des prix probablement sans pr\u00e9c\u00e9dent dans l\u2019histoire de la technologie. Surtout, elle pr\u00e9figure l\u2019av\u00e8nement du \u00abg\u00e9nome pour tous\u00bb.
\n_______<\/p>\n

L\u2019avis de Derik de Bruin, analyste chez UBS<\/strong><\/p>\n

\u00abAvec l\u2019acquisition de Solexa, la soci\u00e9t\u00e9 Illumina a \u00e9t\u00e9 la premi\u00e8re \u00e0 proposer des appareils de s\u00e9quen\u00e7age de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration, qui offrent des rythmes de production \u00e9lev\u00e9s. Elle se trouve aujourd\u2019hui en t\u00eate de ce secteur, avec la plus grande part de march\u00e9 et une technologie de pointe. Illumina a r\u00e9cemment annonc\u00e9 la commande de 51 nouveaux appareils par le Board Institute d\u2019Harvard et le MIT. Nous maintenons notre recommandation d\u2019achat.\u00bb <\/p>\n

\u00abNous conseillons aussi Life Technologies, qui vend \u00e9galement des plateformes de s\u00e9quen\u00e7age de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration. Cette entreprise est mieux diversifi\u00e9e: 80% de ses ventes sont r\u00e9alis\u00e9es avec des r\u00e9actifs chimiques utilis\u00e9s non seulement dans ses appareils, mais \u00e9galement pour de nombreuses op\u00e9rations effectu\u00e9es lors de la recherche en biologie mol\u00e9culaire, ce qui repr\u00e9sente un march\u00e9 plus stable. Life Technologies est \u00e9galement tr\u00e8s solide dans le domaine du s\u00e9quen\u00e7age partiel, utilis\u00e9 pour les analyses forensiques et les tests diagnostics.\u00bb <\/p>\n

\u00abNous avons un rating neutre pour Affymetrix. Ils ont \u00e9t\u00e9 pionniers du d\u00e9cryptage partiel avec leurs produits bas\u00e9s sur les microarrays, mais ils ne d\u00e9montrent pour l\u2019instant aucune perspective pour se se tourner vers les instruments de s\u00e9quen\u00e7age de nouvelle g\u00e9n\u00e9ration. Ceux-ci ne remplaceront probablement pas les microarrays, mais devraient en tout cas emp\u00eacher leur croissance.\u00bb \u00abDe mani\u00e8re g\u00e9n\u00e9rale, il s\u2019agit d\u2019un march\u00e9 risqu\u00e9 o\u00f9 les technologies \u00e9voluent tr\u00e8s rapidement. Les commandes d\u2019appareils d\u00e9pendent en partie des financements de la recherche publique, mis \u00e0 mal par la crise financi\u00e8re. La transition vers un march\u00e9 commercial plus appliqu\u00e9 que la recherche est encore balbutiante et les consolidations repr\u00e9sentent un risque suppl\u00e9mentaire.\u00bb
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Une version de cet article est parue dans Swissquote Magazine (no 4)<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Une poign\u00e9e de firmes luttent sur le march\u00e9 des analyses g\u00e9n\u00e9tiques, o\u00f9 les innovations se succ\u00e8dent \u00e0 une vitesse effr\u00e9n\u00e9e. En ligne de mire: la m\u00e9decine personnalis\u00e9e et le g\u00e9nome individuel. Pr\u00e9sentation d\u2019un march\u00e9 qui d\u00e9finira notre futur. <\/p>\n","protected":false},"author":19478,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[4],"tags":[],"class_list":["post-3263","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-kapital","kapital"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3263","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/19478"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=3263"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3263\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=3263"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=3263"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/largeur.com\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=3263"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}